淮阴三站工程位于淮安市清浦区境内，与现有淮阴一站并列布置，和淮阴一、二站和拟建的洪泽站共同组成南水北调东线第三梯级抽水泵站。泵站采用4台直径3.3m的贯流泵，设计调水流量为100m3/s，工程批复总投资3.09亿元。工程于2005年10月开工建设，2012年10月通过完工验收，目前已移交管理单位运行管理。2008年，淮阴三站工程荣获 “江苏省五一劳动奖状”。