邳州站是南水北调东线第一期工程的第6级抽水泵站，工程的主要任务是与泗洪站、睢宁泵站一起，通过徐洪河输水线向骆马湖输水100m3/s，与中运河共同满足向骆马湖调水275m3/s的目标，并结合房亭河以北地区的排涝。邳州站设计流量100m3/s，装机4台套，其中备用一台，总装机容量7800kW。工程总投资3.28亿元。工程于2011年3月正式开工，2013年2月通过泵站机组试运行验收，4月顺利通过设计单元通水验收。截至2014年10月底，工程累计完成投资3.28亿元，完成全部建设内容并移交管理单位。